pcr中引物的作用

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pcr中引物的作用

pcr中引物的作用:找到一對合適的核苷酸片段,使其能有效地擴增模板DNA序列。引物是人工合成的兩段寡核苷酸序列,一個引物與目的基因一端的一條DNA模板鏈互補,另一個引物與目的基因另一端的另一條DNA模板鏈互補。在PCR(聚合酶鏈式反應)技術中,已知一段目的基因的核苷酸序列,根據這一序列合成引物,利用PCR擴增技術,目的基因DNA受熱變性後解鏈爲單鏈,引物與單鏈相應互補序列結合,然後在DNA聚合酶作用下進行延伸,如此重複循環,延伸後得到的產物同樣可以和引物結合。

1、擴展資料PCR引物設計PCR反應中有兩條引物,即5′端引物和3′引物。

2、設計引物時以一條DNA單鏈爲基準(常以信息鏈爲基準),5′端引物與位於待擴增片段5′端上的一小段DNA序列相同;3′端引物與位於待擴增片段3′端的一小段DNA序列互補。

3、引物設計的基本原則:引物長度:15-30bp,常用爲20bp左右。

4、引物鹼基:G+C含量以40-60%爲宜,G+C太少擴增效果不佳,G+C 過多易出現非特異條帶。

5、ATGC最好隨機分佈,避免5個以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列參照

6、引物內部不應出現互補序列。

7、兩個引物之間不應存在互補序列,尤其是避免3 ′端的互補重疊。

8、引物與非特異擴增區的序列的同源性不要超過70%,引物3′末端連續8個鹼基在待擴增區以外不能有完全互補序列,否則易導致非特異性擴增。

9、引物3‘端的鹼基,特別是最末及倒數第二個鹼基,應嚴格要求配對,最佳選擇是G和C。

10、引物的5′端可以修飾。

11、如附加限制酶位點,引入突變位點,用生物素、熒光物質、地高辛標記,加入其它短序列,包括起始密碼子、終止密碼子等。

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